Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms