Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCC12Q96J65 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms