Protein–RNA interactions for Protein: Q96G28

CFAP36, Cilia- and flagella-associated protein 36, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP36Q96G28 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CFAP36Q96G28 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms