Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.33■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.32■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C18orf8Q96DM3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms