Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms