Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NMD3Q96D46 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms