Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG2BQ96BY7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG2BQ96BY7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG2BQ96BY7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG2BQ96BY7 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG2BQ96BY7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG2BQ96BY7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG2BQ96BY7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG2BQ96BY7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG2BQ96BY7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG2BQ96BY7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG2BQ96BY7 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG2BQ96BY7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG2BQ96BY7 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG2BQ96BY7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG2BQ96BY7 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG2BQ96BY7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG2BQ96BY7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG2BQ96BY7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG2BQ96BY7 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms