Protein–RNA interactions for Protein: Q96B26

EXOSC8, Exosome complex component RRP43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC8Q96B26 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EXOSC8Q96B26 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EXOSC8Q96B26 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EXOSC8Q96B26 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
EXOSC8Q96B26 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EXOSC8Q96B26 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EXOSC8Q96B26 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EXOSC8Q96B26 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
EXOSC8Q96B26 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EXOSC8Q96B26 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EXOSC8Q96B26 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EXOSC8Q96B26 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EXOSC8Q96B26 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EXOSC8Q96B26 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EXOSC8Q96B26 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EXOSC8Q96B26 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EXOSC8Q96B26 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EXOSC8Q96B26 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EXOSC8Q96B26 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EXOSC8Q96B26 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EXOSC8Q96B26 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC8Q96B26 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC8Q96B26 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC8Q96B26 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC8Q96B26 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC8Q96B26 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC8Q96B26 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC8Q96B26 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC8Q96B26 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC8Q96B26 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC8Q96B26 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC8Q96B26 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC8Q96B26 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC8Q96B26 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC8Q96B26 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC8Q96B26 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC8Q96B26 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC8Q96B26 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC8Q96B26 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC8Q96B26 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC8Q96B26 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC8Q96B26 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC8Q96B26 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC8Q96B26 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC8Q96B26 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC8Q96B26 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC8Q96B26 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC8Q96B26 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC8Q96B26 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC8Q96B26 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC8Q96B26 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC8Q96B26 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC8Q96B26 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC8Q96B26 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC8Q96B26 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC8Q96B26 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC8Q96B26 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC8Q96B26 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC8Q96B26 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC8Q96B26 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC8Q96B26 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC8Q96B26 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXOSC8Q96B26 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXOSC8Q96B26 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXOSC8Q96B26 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXOSC8Q96B26 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXOSC8Q96B26 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXOSC8Q96B26 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXOSC8Q96B26 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXOSC8Q96B26 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EXOSC8Q96B26 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EXOSC8Q96B26 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EXOSC8Q96B26 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
EXOSC8Q96B26 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EXOSC8Q96B26 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
EXOSC8Q96B26 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EXOSC8Q96B26 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EXOSC8Q96B26 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EXOSC8Q96B26 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EXOSC8Q96B26 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EXOSC8Q96B26 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
EXOSC8Q96B26 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EXOSC8Q96B26 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EXOSC8Q96B26 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EXOSC8Q96B26 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EXOSC8Q96B26 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
EXOSC8Q96B26 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EXOSC8Q96B26 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EXOSC8Q96B26 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EXOSC8Q96B26 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EXOSC8Q96B26 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EXOSC8Q96B26 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EXOSC8Q96B26 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EXOSC8Q96B26 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EXOSC8Q96B26 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EXOSC8Q96B26 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EXOSC8Q96B26 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19■□□□□ 0.63
EXOSC8Q96B26 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EXOSC8Q96B26 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EXOSC8Q96B26 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms