Protein–RNA interactions for Protein: Q93038

TNFRSF25, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 25, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25Q93038 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFRSF25Q93038 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms