Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAD50Q92878 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms