Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNRQ92752 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNRQ92752 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNRQ92752 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
TNRQ92752 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
TNRQ92752 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNRQ92752 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNRQ92752 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNRQ92752 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNRQ92752 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNRQ92752 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNRQ92752 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNRQ92752 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNRQ92752 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNRQ92752 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNRQ92752 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNRQ92752 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNRQ92752 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
TNRQ92752 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNRQ92752 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNRQ92752 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNRQ92752 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNRQ92752 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNRQ92752 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNRQ92752 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNRQ92752 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNRQ92752 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNRQ92752 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNRQ92752 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNRQ92752 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNRQ92752 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TNRQ92752 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNRQ92752 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNRQ92752 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNRQ92752 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNRQ92752 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNRQ92752 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNRQ92752 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNRQ92752 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNRQ92752 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNRQ92752 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNRQ92752 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNRQ92752 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNRQ92752 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNRQ92752 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNRQ92752 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNRQ92752 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNRQ92752 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
TNRQ92752 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNRQ92752 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNRQ92752 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNRQ92752 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
TNRQ92752 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNRQ92752 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNRQ92752 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNRQ92752 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNRQ92752 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNRQ92752 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNRQ92752 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNRQ92752 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNRQ92752 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNRQ92752 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNRQ92752 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNRQ92752 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
TNRQ92752 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNRQ92752 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNRQ92752 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNRQ92752 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNRQ92752 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNRQ92752 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNRQ92752 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNRQ92752 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNRQ92752 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNRQ92752 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNRQ92752 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNRQ92752 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNRQ92752 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
TNRQ92752 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNRQ92752 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNRQ92752 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNRQ92752 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNRQ92752 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
TNRQ92752 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
TNRQ92752 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNRQ92752 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNRQ92752 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
TNRQ92752 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNRQ92752 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNRQ92752 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNRQ92752 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNRQ92752 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TNRQ92752 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TNRQ92752 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
TNRQ92752 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TNRQ92752 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TNRQ92752 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TNRQ92752 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TNRQ92752 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TNRQ92752 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TNRQ92752 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms