Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPRUQ92729 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRUQ92729 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRUQ92729 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
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