Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF3AQ92664 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms