Protein–RNA interactions for Protein: Q8WY36

BBX, HMG box transcription factor BBX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBXQ8WY36 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
BBXQ8WY36 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBXQ8WY36 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBXQ8WY36 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBXQ8WY36 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBXQ8WY36 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBXQ8WY36 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BBXQ8WY36 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBXQ8WY36 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBXQ8WY36 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBXQ8WY36 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBXQ8WY36 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBXQ8WY36 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BBXQ8WY36 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBXQ8WY36 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBXQ8WY36 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBXQ8WY36 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBXQ8WY36 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBXQ8WY36 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBXQ8WY36 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBXQ8WY36 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBXQ8WY36 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBXQ8WY36 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBXQ8WY36 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBXQ8WY36 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBXQ8WY36 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBXQ8WY36 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BBXQ8WY36 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms