Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNAAF4Q8WXU2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms