Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC4Q8WW27 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC4Q8WW27 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC4Q8WW27 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC4Q8WW27 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC4Q8WW27 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC4Q8WW27 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC4Q8WW27 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC4Q8WW27 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC4Q8WW27 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC4Q8WW27 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC4Q8WW27 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC4Q8WW27 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC4Q8WW27 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC4Q8WW27 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC4Q8WW27 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC4Q8WW27 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC4Q8WW27 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC4Q8WW27 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC4Q8WW27 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC4Q8WW27 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC4Q8WW27 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC4Q8WW27 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC4Q8WW27 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBEC4Q8WW27 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC4Q8WW27 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC4Q8WW27 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC4Q8WW27 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC4Q8WW27 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC4Q8WW27 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC4Q8WW27 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC4Q8WW27 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC4Q8WW27 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC4Q8WW27 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC4Q8WW27 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC4Q8WW27 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC4Q8WW27 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC4Q8WW27 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC4Q8WW27 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC4Q8WW27 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC4Q8WW27 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC4Q8WW27 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC4Q8WW27 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC4Q8WW27 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC4Q8WW27 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC4Q8WW27 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC4Q8WW27 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC4Q8WW27 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBEC4Q8WW27 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
APOBEC4Q8WW27 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
APOBEC4Q8WW27 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBEC4Q8WW27 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms