Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SFT2D1Q8WV19 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms