Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUA4

GTF3C2, General transcription factor 3C polypeptide 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2Q8WUA4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF3C2Q8WUA4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF3C2Q8WUA4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF3C2Q8WUA4 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF3C2Q8WUA4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF3C2Q8WUA4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF3C2Q8WUA4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF3C2Q8WUA4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF3C2Q8WUA4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
GTF3C2Q8WUA4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF3C2Q8WUA4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms