Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms