Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PIK3C3Q8NEB9 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms