Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CARMIL3Q8ND23 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms