Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HJURPQ8NCD3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms