Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FSIP1Q8NA03 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms