Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD42Q8N9B4 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD42Q8N9B4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD42Q8N9B4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD42Q8N9B4 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD42Q8N9B4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD42Q8N9B4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD42Q8N9B4 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD42Q8N9B4 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD42Q8N9B4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD42Q8N9B4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD42Q8N9B4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD42Q8N9B4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD42Q8N9B4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD42Q8N9B4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD42Q8N9B4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD42Q8N9B4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD42Q8N9B4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD42Q8N9B4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD42Q8N9B4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD42Q8N9B4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD42Q8N9B4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD42Q8N9B4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD42Q8N9B4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD42Q8N9B4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms