Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
AMER3Q8N944 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
AMER3Q8N944 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AMER3Q8N944 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AMER3Q8N944 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
AMER3Q8N944 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
AMER3Q8N944 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
AMER3Q8N944 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AMER3Q8N944 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
AMER3Q8N944 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AMER3Q8N944 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
AMER3Q8N944 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AMER3Q8N944 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
AMER3Q8N944 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
AMER3Q8N944 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AMER3Q8N944 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
AMER3Q8N944 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
AMER3Q8N944 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AMER3Q8N944 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AMER3Q8N944 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AMER3Q8N944 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AMER3Q8N944 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
AMER3Q8N944 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AMER3Q8N944 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
AMER3Q8N944 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
AMER3Q8N944 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
AMER3Q8N944 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AMER3Q8N944 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms