Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLDN19Q8N6F1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLDN19Q8N6F1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLDN19Q8N6F1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLDN19Q8N6F1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLDN19Q8N6F1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLDN19Q8N6F1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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CLDN19Q8N6F1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLDN19Q8N6F1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLDN19Q8N6F1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLDN19Q8N6F1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLDN19Q8N6F1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLDN19Q8N6F1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLDN19Q8N6F1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLDN19Q8N6F1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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CLDN19Q8N6F1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLDN19Q8N6F1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLDN19Q8N6F1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLDN19Q8N6F1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLDN19Q8N6F1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLDN19Q8N6F1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLDN19Q8N6F1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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CLDN19Q8N6F1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLDN19Q8N6F1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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CLDN19Q8N6F1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLDN19Q8N6F1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLDN19Q8N6F1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLDN19Q8N6F1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLDN19Q8N6F1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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CLDN19Q8N6F1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLDN19Q8N6F1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLDN19Q8N6F1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLDN19Q8N6F1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLDN19Q8N6F1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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CLDN19Q8N6F1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLDN19Q8N6F1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLDN19Q8N6F1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLDN19Q8N6F1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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CLDN19Q8N6F1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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CLDN19Q8N6F1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CLDN19Q8N6F1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CLDN19Q8N6F1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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CLDN19Q8N6F1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CLDN19Q8N6F1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CLDN19Q8N6F1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CLDN19Q8N6F1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CLDN19Q8N6F1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CLDN19Q8N6F1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CLDN19Q8N6F1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CLDN19Q8N6F1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CLDN19Q8N6F1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CLDN19Q8N6F1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CLDN19Q8N6F1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CLDN19Q8N6F1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CLDN19Q8N6F1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CLDN19Q8N6F1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CLDN19Q8N6F1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLDN19Q8N6F1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLDN19Q8N6F1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLDN19Q8N6F1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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