Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LTBP4Q8N2S1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms