Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G4

LRRC47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC47Q8N1G4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRC47Q8N1G4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC47Q8N1G4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC47Q8N1G4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC47Q8N1G4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC47Q8N1G4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC47Q8N1G4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC47Q8N1G4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC47Q8N1G4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC47Q8N1G4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC47Q8N1G4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC47Q8N1G4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC47Q8N1G4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC47Q8N1G4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC47Q8N1G4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC47Q8N1G4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC47Q8N1G4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC47Q8N1G4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC47Q8N1G4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC47Q8N1G4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC47Q8N1G4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC47Q8N1G4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC47Q8N1G4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC47Q8N1G4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC47Q8N1G4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC47Q8N1G4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC47Q8N1G4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC47Q8N1G4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC47Q8N1G4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC47Q8N1G4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC47Q8N1G4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC47Q8N1G4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC47Q8N1G4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC47Q8N1G4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC47Q8N1G4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC47Q8N1G4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC47Q8N1G4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC47Q8N1G4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC47Q8N1G4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC47Q8N1G4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC47Q8N1G4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC47Q8N1G4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC47Q8N1G4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC47Q8N1G4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC47Q8N1G4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC47Q8N1G4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC47Q8N1G4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC47Q8N1G4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC47Q8N1G4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC47Q8N1G4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC47Q8N1G4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC47Q8N1G4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC47Q8N1G4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC47Q8N1G4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC47Q8N1G4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC47Q8N1G4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC47Q8N1G4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms