Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZC4

RTKN2, Rhotekin-2, humanhuman

Predictions only

Length 609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKN2Q8IZC4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RTKN2Q8IZC4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTKN2Q8IZC4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTKN2Q8IZC4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTKN2Q8IZC4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTKN2Q8IZC4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTKN2Q8IZC4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTKN2Q8IZC4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTKN2Q8IZC4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RTKN2Q8IZC4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RTKN2Q8IZC4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTKN2Q8IZC4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTKN2Q8IZC4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTKN2Q8IZC4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTKN2Q8IZC4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTKN2Q8IZC4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTKN2Q8IZC4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTKN2Q8IZC4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTKN2Q8IZC4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms