Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms