Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFNL1Q8IU54 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
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