Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

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Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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