Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms