Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTF1AQ7RTS3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PTF1AQ7RTS3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms