Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SV2AQ7L0J3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms