Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDZD4Q76G19 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms