Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CAPN12Q6ZSI9 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPN12Q6ZSI9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms