Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFXL1Q6ZNB6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms