Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN03

LINC00322, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00322, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00322Q6ZN03 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00322Q6ZN03 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms