Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms