Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms