Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms