Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY1

TMEM88, Transmembrane protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88Q6PEY1 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM88Q6PEY1 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM88Q6PEY1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM88Q6PEY1 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM88Q6PEY1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM88Q6PEY1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM88Q6PEY1 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM88Q6PEY1 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM88Q6PEY1 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM88Q6PEY1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM88Q6PEY1 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM88Q6PEY1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM88Q6PEY1 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM88Q6PEY1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM88Q6PEY1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM88Q6PEY1 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM88Q6PEY1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM88Q6PEY1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM88Q6PEY1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM88Q6PEY1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM88Q6PEY1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM88Q6PEY1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM88Q6PEY1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM88Q6PEY1 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM88Q6PEY1 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM88Q6PEY1 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM88Q6PEY1 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM88Q6PEY1 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM88Q6PEY1 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM88Q6PEY1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM88Q6PEY1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM88Q6PEY1 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM88Q6PEY1 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM88Q6PEY1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM88Q6PEY1 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM88Q6PEY1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM88Q6PEY1 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM88Q6PEY1 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM88Q6PEY1 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM88Q6PEY1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM88Q6PEY1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM88Q6PEY1 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM88Q6PEY1 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM88Q6PEY1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM88Q6PEY1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM88Q6PEY1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM88Q6PEY1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM88Q6PEY1 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM88Q6PEY1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM88Q6PEY1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM88Q6PEY1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM88Q6PEY1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM88Q6PEY1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM88Q6PEY1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM88Q6PEY1 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM88Q6PEY1 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM88Q6PEY1 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM88Q6PEY1 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM88Q6PEY1 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM88Q6PEY1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM88Q6PEY1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM88Q6PEY1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM88Q6PEY1 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM88Q6PEY1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM88Q6PEY1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TMEM88Q6PEY1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM88Q6PEY1 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms