Protein–RNA interactions for Protein: Q6P461

ACSM6, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM6, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM6Q6P461 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACSM6Q6P461 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACSM6Q6P461 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ACSM6Q6P461 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACSM6Q6P461 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACSM6Q6P461 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACSM6Q6P461 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACSM6Q6P461 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ACSM6Q6P461 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACSM6Q6P461 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACSM6Q6P461 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACSM6Q6P461 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACSM6Q6P461 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACSM6Q6P461 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACSM6Q6P461 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACSM6Q6P461 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACSM6Q6P461 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACSM6Q6P461 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACSM6Q6P461 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACSM6Q6P461 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACSM6Q6P461 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACSM6Q6P461 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACSM6Q6P461 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACSM6Q6P461 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACSM6Q6P461 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACSM6Q6P461 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACSM6Q6P461 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACSM6Q6P461 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACSM6Q6P461 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACSM6Q6P461 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACSM6Q6P461 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACSM6Q6P461 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACSM6Q6P461 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACSM6Q6P461 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACSM6Q6P461 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACSM6Q6P461 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACSM6Q6P461 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACSM6Q6P461 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACSM6Q6P461 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACSM6Q6P461 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACSM6Q6P461 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACSM6Q6P461 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACSM6Q6P461 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACSM6Q6P461 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACSM6Q6P461 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACSM6Q6P461 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACSM6Q6P461 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACSM6Q6P461 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACSM6Q6P461 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACSM6Q6P461 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACSM6Q6P461 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ACSM6Q6P461 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACSM6Q6P461 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACSM6Q6P461 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ACSM6Q6P461 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACSM6Q6P461 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACSM6Q6P461 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACSM6Q6P461 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACSM6Q6P461 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACSM6Q6P461 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACSM6Q6P461 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACSM6Q6P461 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACSM6Q6P461 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACSM6Q6P461 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACSM6Q6P461 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACSM6Q6P461 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACSM6Q6P461 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACSM6Q6P461 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ACSM6Q6P461 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACSM6Q6P461 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACSM6Q6P461 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACSM6Q6P461 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACSM6Q6P461 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACSM6Q6P461 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACSM6Q6P461 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACSM6Q6P461 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACSM6Q6P461 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACSM6Q6P461 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACSM6Q6P461 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACSM6Q6P461 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACSM6Q6P461 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACSM6Q6P461 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ACSM6Q6P461 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACSM6Q6P461 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACSM6Q6P461 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACSM6Q6P461 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACSM6Q6P461 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACSM6Q6P461 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACSM6Q6P461 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACSM6Q6P461 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACSM6Q6P461 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSM6Q6P461 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSM6Q6P461 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSM6Q6P461 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSM6Q6P461 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSM6Q6P461 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSM6Q6P461 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSM6Q6P461 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSM6Q6P461 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSM6Q6P461 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms