Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD54Q6NXT1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms