Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms