Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQQ9

OTUD7B, OTU domain-containing protein 7B, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD7BQ6GQQ9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTUD7BQ6GQQ9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTUD7BQ6GQQ9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTUD7BQ6GQQ9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTUD7BQ6GQQ9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTUD7BQ6GQQ9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTUD7BQ6GQQ9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTUD7BQ6GQQ9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTUD7BQ6GQQ9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTUD7BQ6GQQ9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTUD7BQ6GQQ9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTUD7BQ6GQQ9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTUD7BQ6GQQ9 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTUD7BQ6GQQ9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
OTUD7BQ6GQQ9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTUD7BQ6GQQ9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
OTUD7BQ6GQQ9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTUD7BQ6GQQ9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTUD7BQ6GQQ9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTUD7BQ6GQQ9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTUD7BQ6GQQ9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTUD7BQ6GQQ9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTUD7BQ6GQQ9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTUD7BQ6GQQ9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTUD7BQ6GQQ9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTUD7BQ6GQQ9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTUD7BQ6GQQ9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTUD7BQ6GQQ9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTUD7BQ6GQQ9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTUD7BQ6GQQ9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTUD7BQ6GQQ9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTUD7BQ6GQQ9 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
OTUD7BQ6GQQ9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTUD7BQ6GQQ9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTUD7BQ6GQQ9 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTUD7BQ6GQQ9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTUD7BQ6GQQ9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTUD7BQ6GQQ9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTUD7BQ6GQQ9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTUD7BQ6GQQ9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTUD7BQ6GQQ9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTUD7BQ6GQQ9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTUD7BQ6GQQ9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTUD7BQ6GQQ9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTUD7BQ6GQQ9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTUD7BQ6GQQ9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTUD7BQ6GQQ9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
OTUD7BQ6GQQ9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
OTUD7BQ6GQQ9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
OTUD7BQ6GQQ9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTUD7BQ6GQQ9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTUD7BQ6GQQ9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTUD7BQ6GQQ9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTUD7BQ6GQQ9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTUD7BQ6GQQ9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTUD7BQ6GQQ9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTUD7BQ6GQQ9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
OTUD7BQ6GQQ9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTUD7BQ6GQQ9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTUD7BQ6GQQ9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTUD7BQ6GQQ9 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTUD7BQ6GQQ9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTUD7BQ6GQQ9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTUD7BQ6GQQ9 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
OTUD7BQ6GQQ9 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTUD7BQ6GQQ9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTUD7BQ6GQQ9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTUD7BQ6GQQ9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTUD7BQ6GQQ9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTUD7BQ6GQQ9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTUD7BQ6GQQ9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTUD7BQ6GQQ9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
OTUD7BQ6GQQ9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTUD7BQ6GQQ9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTUD7BQ6GQQ9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTUD7BQ6GQQ9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTUD7BQ6GQQ9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTUD7BQ6GQQ9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OTUD7BQ6GQQ9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
OTUD7BQ6GQQ9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OTUD7BQ6GQQ9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
OTUD7BQ6GQQ9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OTUD7BQ6GQQ9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
OTUD7BQ6GQQ9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
OTUD7BQ6GQQ9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OTUD7BQ6GQQ9 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OTUD7BQ6GQQ9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
OTUD7BQ6GQQ9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
OTUD7BQ6GQQ9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OTUD7BQ6GQQ9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OTUD7BQ6GQQ9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OTUD7BQ6GQQ9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OTUD7BQ6GQQ9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OTUD7BQ6GQQ9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
OTUD7BQ6GQQ9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OTUD7BQ6GQQ9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
OTUD7BQ6GQQ9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
OTUD7BQ6GQQ9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
OTUD7BQ6GQQ9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
OTUD7BQ6GQQ9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms