Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG16L1Q676U5 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG16L1Q676U5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms