Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWQ0

RSBN1, Round spermatid basic protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSBN1Q5VWQ0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RSBN1Q5VWQ0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms