Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU97

CACHD1, VWFA and cache domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACHD1Q5VU97 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACHD1Q5VU97 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACHD1Q5VU97 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACHD1Q5VU97 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACHD1Q5VU97 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACHD1Q5VU97 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACHD1Q5VU97 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACHD1Q5VU97 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACHD1Q5VU97 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACHD1Q5VU97 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACHD1Q5VU97 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACHD1Q5VU97 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACHD1Q5VU97 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACHD1Q5VU97 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACHD1Q5VU97 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACHD1Q5VU97 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACHD1Q5VU97 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACHD1Q5VU97 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACHD1Q5VU97 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACHD1Q5VU97 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACHD1Q5VU97 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACHD1Q5VU97 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CACHD1Q5VU97 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACHD1Q5VU97 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACHD1Q5VU97 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACHD1Q5VU97 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACHD1Q5VU97 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACHD1Q5VU97 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACHD1Q5VU97 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACHD1Q5VU97 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACHD1Q5VU97 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACHD1Q5VU97 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACHD1Q5VU97 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACHD1Q5VU97 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACHD1Q5VU97 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACHD1Q5VU97 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACHD1Q5VU97 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACHD1Q5VU97 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACHD1Q5VU97 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACHD1Q5VU97 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACHD1Q5VU97 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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CACHD1Q5VU97 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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CACHD1Q5VU97 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACHD1Q5VU97 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACHD1Q5VU97 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACHD1Q5VU97 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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CACHD1Q5VU97 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
CACHD1Q5VU97 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CACHD1Q5VU97 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
CACHD1Q5VU97 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CACHD1Q5VU97 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACHD1Q5VU97 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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CACHD1Q5VU97 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACHD1Q5VU97 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACHD1Q5VU97 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACHD1Q5VU97 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACHD1Q5VU97 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACHD1Q5VU97 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACHD1Q5VU97 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACHD1Q5VU97 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACHD1Q5VU97 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACHD1Q5VU97 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACHD1Q5VU97 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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CACHD1Q5VU97 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACHD1Q5VU97 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACHD1Q5VU97 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACHD1Q5VU97 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACHD1Q5VU97 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACHD1Q5VU97 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACHD1Q5VU97 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACHD1Q5VU97 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACHD1Q5VU97 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACHD1Q5VU97 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACHD1Q5VU97 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACHD1Q5VU97 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACHD1Q5VU97 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACHD1Q5VU97 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CACHD1Q5VU97 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CACHD1Q5VU97 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CACHD1Q5VU97 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CACHD1Q5VU97 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CACHD1Q5VU97 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CACHD1Q5VU97 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CACHD1Q5VU97 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CACHD1Q5VU97 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CACHD1Q5VU97 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CACHD1Q5VU97 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CACHD1Q5VU97 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CACHD1Q5VU97 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CACHD1Q5VU97 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CACHD1Q5VU97 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CACHD1Q5VU97 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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